Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnb1Q03717 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnb1Q03717 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms