Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scg2Q03517 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scg2Q03517 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms