Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms