Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms