Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh1Q02576 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms