Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms