Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VcpQ01853 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms