Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mc1rQ01727 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms