Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col1a2Q01149 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col1a2Q01149 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms