Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SeleQ00690 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms