Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabpb1Q00420 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms