Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms