Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp10Q000W5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms