Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp1P97350 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms