Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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