Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms