Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx1P81068 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms