Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms