Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms