Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smad1P70340 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smad1P70340 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms