Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp3P70281 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms