Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd13P70217 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms