Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrig1P70193 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrig1P70193 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrig1P70193 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrig1P70193 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms