Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn5P68500 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn5P68500 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms