Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms