Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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