Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
UbdP63072 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbdP63072 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbdP63072 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms