Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rab3cP62823 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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