Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Snrpd1P62315 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Snrpd1P62315 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Snrpd1P62315 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Snrpd1P62315 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Snrpd1P62315 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd1P62315 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Snrpd1P62315 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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