Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rps29P62274 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rps29P62274 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rps29P62274 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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