Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp46P62069 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp46P62069 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp46P62069 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp46P62069 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp46P62069 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp46P62069 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp46P62069 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp46P62069 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp46P62069 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms