Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga11P61622 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms