Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms