Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms