Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms