Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk2P58801 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms