Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms