Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samsn1P57725 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms