Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1bbP56400 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms