Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms