Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp1P55194 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms