Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp10P52479 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp10P52479 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp10P52479 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms