Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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SftpbP50405 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SftpbP50405 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SftpbP50405 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SftpbP50405 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SftpbP50405 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SftpbP50405 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SftpbP50405 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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