Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms