Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psen1P49769 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms