Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms