Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms