Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scg3P47867 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg3P47867 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg3P47867 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg3P47867 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg3P47867 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms