Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic1P46684 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic1P46684 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic1P46684 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zic1P46684 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zic1P46684 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zic1P46684 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zic1P46684 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zic1P46684 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zic1P46684 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zic1P46684 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zic1P46684 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms