Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms